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机器学习是计算机科学和统计学的边缘交叉领域,R关于机器学习的包主要包括以下几个方面:
1)神经网络(Neural Networks): nnet包执行单隐层前馈神经网络,nnet是VR包的一部分()。 2)递归拆分(Recursive Partitioning): 递归拆分利用树形结构模型,来做回归、分类和生存分析,主要在rpart包()和tree包()里执行,尤其推荐rpart包。Weka里也有这样的递归拆分法,如:J4.8, C4.5, M5,包Rweka提供了R与Weka的函数的接口()。 party包提供两类递归拆分算法,能做到无偏的变量选择和停止标准:函数ctree()用非参条件推断法检测自变量和因变量的关系;而函数mob()能用来建立参数模型()。另外,party包里也提供二分支树和节点分布的可视化展示。 mvpart包是rpart的改进包,处理多元因变量的问题()。rpart.permutation包用置换法(permutation)评估树的有效性()。knnTree包建立一个分类树,每个叶子节点是一个knn分类器()。LogicReg包做逻辑回归分析,针对大多数自变量是二元变量的情况()。maptree包()和pinktoe包()提供树结构的可视化函数。 3)随机森林(Random Forests): randomForest 包提供了用随机森林做回归和分类的函数()。ipred包用bagging的思想做回归,分类和生存分析,组合多个模型()。party包也提供了基于条件推断树的随机森林法()。varSelRF包用随机森林法做变量选择()。 4)Regularized and Shrinkage Methods: lasso2包()和lars包()可以执行参数受到某些限制的回归模型。elasticnet包可计算所有的收缩参数()。glmpath包可以得到广义线性模型和COX模型的L1 regularization path()。penalized包执行lasso (L1) 和ridge (L2)惩罚回归模型(penalized regression models)()。pamr包执行缩小重心分类法(shrunken centroids classifier)()。earth包可做多元自适应样条回归(multivariate adaptive regression splines)()。 5)Boosting : gbm包()和boost包()执行多种多样的梯度boosting算法,gbm包做基于树的梯度下降boosting,boost包包括LogitBoost和L2Boost。GAMMoost包提供基于boosting的广义相加模型(generalized additive models)的程序()。mboost包做基于模型的boosting()。 6)支持向量机(Support Vector Machines): e1071包的svm()函数提供R和LIBSVM的接口 ()。kernlab包为基于核函数的学习方法提供了一个灵活的框架,包括SVM、RVM……() 。klaR 包提供了R和SVMlight的接口()。 7)贝叶斯方法(Bayesian Methods): BayesTree包执行Bayesian Additive Regression Trees (BART)算法(,)。tgp包做Bayesian半参数非线性回归(Bayesian nonstationary, semiparametric nonlinear regression)()。 8)基于遗传算法的最优化(Optimization using Genetic Algorithms): gafit包()和rgenoud包()提供基于遗传算法的最优化程序。 9)关联规则(Association Rules): arules包提供了有效处理稀疏二元数据的数据结构,而且提供函数执Apriori和Eclat算法挖掘频繁项集、最大频繁项集、闭频繁项集和关联规则()。 10)模型选择和确认(Model selection and validation): e1071包的tune()函数在指定的范围内选取合适的参数()。ipred包的errorest()函数用重抽样的方法(交叉验证,bootstrap)估计分类错误率()。svmpath包里的函数可用来选取支持向量机的cost参数C()。ROCR包提供了可视化分类器执行效果的函数,如画ROC曲线()。caret包供了各种建立预测模型的函数,包括参数选择和重要性量度()。caretLSF包()和caretNWS()包提供了与caret包类似的功能。 11)统计学习基础(Elements of Statistical Learning): 书《The Elements of Statistical Learning: Data Mining, Inference, and Prediction 》()里的数据集、函数、例子都被打包放在ElemStatLearn包里()。网址:维护人员:Torsten Hothorn